Akvaariopumput ajavat vettä suodatusjärjestelmiin tai niistä pois. Pumput toimivat muodostamalla paine-eroja imu- ja lähtöventtiilien välillä.
Ilmastuspumput
Ilmastuspumput hyödyntävät putkessa olevan veden ilmavoimia. Kun ilma pumpataan vesiputkeen, jatkuva nousevien kuplien virta "vetää" vettä ylöspäin suuntautuvassa liikkeessään. Ilmastussuodattimet ovat erittäin halpoja ja niitä käytetään yleisesti pienissä akvaarioissa, joiden paino on enintään 20 gallonaa. Tärisevä pumppu luo ilmanpaineen putkea pitkin ja on kytketty joko imuaukon pohjaan tai suodattimen paluuosaan. Jos pumppu on kytketty paluuputkeen, käytetään vesilukkoa veden viemiseen suodattimeen. Jos pumppu on kytketty imuputkeen, painovoimaa käytetään veden palauttamiseen.
Tehosuodatinpumput
Tehosuodattimet toimivat magneettisesti. Ne on kiinnitetty suodattimeen, liukuvat yleensä yhteen ja toimivat yhtenä yksikkönä. Voimapumpuissa käytetään kahta magneettia; yksi on kiinnitetty siipipyörään suodattimen sisällä ja toinen moottoriin. Kun moottorin magneetti pyörii, se saa myös juoksupyörään kiinnitetyn magneetin pyöriä. Pyörivä juoksupyörä työntää vettä putkea pitkin joko suodattimeen tai sieltä pois.
Ulkoiset pumput
Ulkoisia pumppuja ylläpidetään akvaarion ulkopuolella ja niillä on kolme luokitusta: keskipako, kalvo ja peristalttinen. Keskipakopumput, kuten liitetyt tehosuodatinpumput, toimivat magneettisesti. Pyörivä juoksupyörä pakottaa vettä siipipyörän kotelon ulkopuolelle ja putken läpi. Juoksupyörät ja moottorit ovat suurempia ja paljon vahvempia kuin tehosuodatinpumpuissa olevat. Ne voivat pumpata suuria määriä vettä suodatusjärjestelmän läpi lyhyessä ajassa ja niitä käytetään yleensä suuremmissa säiliöissä (55 gallonaa tai enemmän). Kalvopumput toimittavat vettä pulsseina, kun moottori avaa ja sulkee kalvon pakottaen veden sisään ja ulos kammiosta. Peristalttiset pumput käyttävät rullia joustavien vesiputkien varrella veden pumppaamiseen. Kun tela liukuu letkun yli, vesi työnnetään telan suuntaan. Peristalttisia ja kalvopumppuja käyttää kokeneempi harrastaja, joka haluaa ylläpitää hyvin erityisiä veden laatuparametreja.
Uppopumput
Uppopumput ovat magneettikäyttöisiä pumppuja, jotka sijoitetaan akvaarion sisään. Ne ovat tehokkaita, käteviä ja pieniä, mutta niissä on muutama varoitus. Uppopumput tuottavat lämpöä ja voivat johtaa akvaarion ylikuumenemiseen. Koska se on veden alla, sähköjohtoihin on kiinnitettävä erityistä huomiota ja lyhytkestoisten häiriöiden ja sähköiskujen välttämiseksi.
